Emre Taner, Millî İstihbarat Teşkilatı'nın başında bulunduğu dönemde önemli gelişmelere tanıklık etti. Ancak, görev süresi boyunca yaşanan bazı tartışmalı olaylar, onun istifasını zorunlu hale getirdi. Özellikle "Habur Rezaleti" olarak adlandırılan durum, istifa kararının arkasındaki temel nedenlerden biri olarak öne çıkıyor. Taner’in, Başbakan ile yaptığı görüşmenin ardından aldığı tepkiler, bu sürecin nasıl geliştiğini ve sonuçlandığını aydınlatıyor.
Emre Taner, 26 Mayıs 2010 tarihinde, görev süresi dört kez uzatıldıktan sonra Millî İstihbarat Teşkilatı Müsteşarlığı görevinden emekli olmuştur.
İstifa kararının nedeni olarak, "Habur Rezaleti" olarak anılan olay gösterilmiştir. İddiaya göre, Başbakan Recep Tayyip Erdoğan ile bir görüşme sonrası kuru bir "teşekkür" ve eline tutuşturulan bir plaketle görevinden gönderilmiştir.
